台灣的特種部隊在1956年成立，專門負責執行秘密任務，又稱“武漢部隊”(注：當時臺當局希望特種部隊能像武昌起義部隊一樣打響“反攻複國”的第一槍)。軍方在1951年至1953年間，曾有傘兵遊擊運用計劃和遊擊空降部隊的訓練計劃。一些資料顯示在特種部隊編成前，臺軍方當時是準備將空降部隊和受過傘訓的遊擊隊空投大陸進行後方作戰的。

    當時臺軍特種部隊下轄4個特戰總隊。特戰第一總隊是因“8·23金門炮戰”和“支援西藏抗暴運動”成立，編制約4000人。為了模擬到西藏的長途飛行和經長途飛行後對作戰能力的影響，特戰隊員經常搭著C-46運輸機繞著台灣長途飛行後跳傘進行演習。

    特戰第二及第三總隊于1956年成立，完全按美制編制及訓練，每個特戰部隊編制約3000人，部隊駐有美軍顧問隨軍進行訓練。不過這項美援特訓，是因當時台灣和美國在大陸情報蒐集行動上合作密切的結果，故台灣順勢要求美方代訓特種部隊。特戰第四總隊是1962年接收滇緬邊區遊擊隊4000多人編成。不過特戰一、四總隊並不為美軍顧問團承認，所以沒有美軍顧問。目前臺軍方還存有從1957年5月至1962年8月“特種部隊組訓及作戰管制與運用原則”相關檔案。

    特種部隊因具有陸、海、空三棲特性，任務性質特殊，所以平時與戰時隸屬關係也不同。平時建制屬陸軍總部管轄，由陸軍統一指揮節制，表面上與陸軍似乎沒什麼不一樣，但實質上卻有很大的區別，很多任務都是由“國防部”特種情報室或情報局直接指揮，甚至與美國中央情報局(即西方公司)合作。

    當時又有一種說法是歸，神秘的“316指揮部”運用，但成立之初的臺軍特種部隊真正的幕後大老闆應是蔣經國。戰時特種部隊的運用歸情報部門統一指揮節制，成為情報部門在敵後惟一的武裝部隊，專門從事情報蒐集工作或執行特種作戰任務。

    在國共對抗的時代，雖然表面沒有大規摸“熱戰”，但當時臺軍特戰部隊可說是一直處於戰爭狀態。1960年4月，當時任臺“國防會議副秘書長”的蔣經國就曾邀請駐臺美軍協防司令史慕德將軍前往中部參觀特種部隊，以爭取協助空投特戰部隊到大陸打遊擊，不過美方最終沒有同意。

    當時臺軍特種部隊編組，無論形態及員額等方面，與一般陸軍野戰部隊有極大的差異。特種部隊編組形態以總隊為單位，總隊之下分為團作戰分隊(又稱為大隊，其中又可分為作戰大隊、突擊大隊、偵查大隊、情報大隊等)，營作戰分隊(又稱為中隊)，連作戰分隊(又稱為分隊)共4級編成。

    其中，連作戰分隊(分隊)為主幹，每一個連作戰分隊(分隊)的編組人數，根據任務需要而定，隊員人數最多僅有十余人，由具有各種兵種專長的隊員組合而成，下分支援組、爆破組、火力組和突擊組，每組3人。除個人已具備原有兵種專長外，在分隊組合完成之後，還必須進一步學習其他兵種的專門知識，使每位隊員均能成為全方位的人才，以適應複雜多變的戰場環境。

    特種部隊下轄的4個總隊，每個總隊的主要任務皆不相同。總隊下各個作戰大隊編組是以地區任務為主，因此所屬各中隊軍官、士官都以同一省份為原則。例如某中隊任務地區為湖南，該中隊所有軍官、士官全是湖南人，一旦日後空降到任務區內，可以馬上融人當地，對進行遊擊戰有很大的幫助。另外各總隊還有自己的作戰專長，如敵後作戰、空降突擊、遊擊戰等。（軍事文摘）