陳水扁“執政”八年來，在外交上一味短打執行“過境外交”、“烽火外交”，短視近利只求一時效果，終於在卸任前十八天爆發巴紐十億建交金遭侵吞。以此世紀大醜聞成為扁當局八年外交的最後注腳，讓扁下臺身影再添難堪一筆。 

　　中國時報指出，儘管邱義仁已表示會一肩扛起責任，但事實上，此弊案的發生，扁難辭其咎，應該負起相對應的政治責任。 

　　審視此一“外交”醜聞目前曝光的情節，整個案子從決定到執行過程之輕率，到令人咋舌的地步。 

　　“外交”工作需要長期經營和綿密的佈線、鋪陳，但從此案看來，扁當局的“外交”網路何其脆弱，竟然只是依憑扁的兩大心腹邱義仁、黃志芳，直接對扁負責的單線作業，如此單薄決策模式自是讓人有機可趁。 

　　只憑柯承亨相信金紀玖，邱義仁就相信金而跳過“國安”查核，金再找來吳思材，所有的連結僅架構在“信任”兩字上，結果“國庫”中的十億元就輕輕鬆鬆地給騙走了。 

　　從牽線人柯承亨與扁的親近關係，到扁聽取“建交”條件到最後生變等報告，這項機密“外交”顯然是在扁知情、同意及授權下進行。邱義仁在執行層面犯下“識人不明”嚴重錯誤，身為機密“外交”拍板定案者的陳水扁當然也難辭其咎。 

　　就目前案情發展來看，雖看不出吳金兩位中間人和扁有直接關係或政治獻金糾葛，但從政治責任來看，扁是脫不了關係，也推卸不了責任。 

　　這場風暴在距離扁卸任前夕引爆，影響的不只是扁個人的歷史定位和執政評價，更讓亟欲從選舉挫敗爬起中民進黨，在毫無防備下突又受重擊再度倒地，跌入更深、更低迷的谷底。