呂秀蓮就任代理黨主席做出大動作，不僅令民進黨上下一片錯愕，據說打亂了陳水扁閉關一星期，苦想出來的人事佈局及其他計劃。

呂秀蓮親赴高雄捷運工地視察，回台北之後參加人權座談會，兩度痛責高捷案。她說：“若一個公共工程不斷崩塌，造成對週遭居民的威脅，這就是侵犯人權。”

她又指出，保障人權不能停留在過去，老講二二八事件、戒嚴，更要“監督當下”，將邀請學者專家籌組“高雄捷運工程民間監督聯盟”，調查時要不分顏色、毋枉毋縱。呂秀蓮不但質疑高捷工程的坍塌事件，更發現整個工程的地下水文探勘有偏差，有一段路線離高雄運河非常近。她說：“即使未來勉強完工，也會留下很多問題。”在呂秀蓮及謝長廷先後視察高雄捷運工程的下午，又發生了兩年內第九次的塌陷事件。

呂秀蓮並且聲明要以代理黨主席的身份，依陳水扁的意思成立廉政委員會，要求黨員執行公務必須守法，公務人員在行政程式上依良心秉公處理業務。

民進黨內對此反應激烈，有人指責呂秀蓮企圖心過強，在“玩”代理主席的角色，以代主席身份調查高捷工程，使民進黨黨政體系混亂不安。但是呂代主席強調，她是以“副總統”身份視察，以人權角度關心高捷工程。有黨內人士認為，代理黨主席管好黨務就可以了，為什麼要去做行政部門的事？“立委”王幸男直言：“狗不要去咬老鼠，代理主席做好黨的事情就好了。”

但是實際上呂秀蓮這個代理黨主席想管黨務也是寸步難行。因為她當上主席是會場上失控而演變出的意外，陳水扁原本計劃推出民進黨“立委”總召趙永清暫時代理主席，代理期間只看守維持而已，爭取時間安排正式黨主席及其他重要職位的人事佈局。不料在會中有人指趙永清資歷不足，他是前國民黨員投靠綠營，難以服眾。周清玉提名呂秀蓮，大家礙于呂女士是位老資格民進黨黨員，又位居“副總統”，一時不便反對，呂秀蓮也沒有推辭，就如此這般登上黨主席寶座。雖然是代理主席，但並沒明文規定她不能執行黨主席的職權。

據說有人將這項消息向“總統”彙報，阿扁氣到不接電話。緊接著呂秀蓮以黨主席身份動作頻頻，陳水扁更加不滿，以“吃人夠夠”（咄咄逼人）來形容她。並且取消了週一與呂的例會，阿扁真的生氣了，根本不想見她。

但是新代理主席不為所動，密集約見黨內一級主管，並安排與中常委及派系領袖餐敘。在中常委會議上，呂秀蓮表示黨中央不應僅僅是選舉機器，還要有決策功能。她提出在代理期間除了辦理黨主席補選，為響應社會期待，必須推動更多黨務改革，要舉辦黨務革新會議。顯示出她要做好黨務的決心！但是立刻有黨內大老柯建銘反對，他認為民進黨明年一月中補選主席如果此時又辦革新會議，不但過於倉促，還增加外界的揣測。一邊開革新會議，一邊黨主席候選人發表政見，到時候聽誰的？

另外新潮流係的大老吳乃仁也說，民進黨的敗選，不是因為黨內出了問題，現階段人民最希望看到的也不是民進黨黨務改革問題，這部份留給新主席去做。看來這位代理主席既不能去咬老鼠，做一隻看門狗也不要吠聲連連，真是苦了呂秀蓮。

這些都不能遏止呂秀蓮的勃勃雄心，她在民進黨內時時都在獨樹一幟，孤軍奮戰。她覬覦大位之心熾熱不退，衡量局勢，也看準了謝長廷要陪高雄捷運工程殉葬，在此落井下石痛批高捷案，儘速消滅一位競爭對手。阿扁的任期只有兩年多一點，政治上不可能有所作為，一心只想保住權位不要過早地當上“跛腳總統”。他沒有別的招數只有在安排民進黨接班人這一局棋中，操控玩弄以保住制高點。目前民進黨內最大的兩股勢力還是蘇貞昌與謝長廷的對峙，短期內阿扁仍舊要在這兩派人馬之間遊弋，取得微妙的平衡。呂秀蓮的連番突襲，又打亂了陳水扁的佈局。局面看似複雜，其實各人的用心很一致，出發點就是一個“私”字。(馬康莊 台灣民意調查基金會秘書長)

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