9日，，雖然最近在野黨掀起大陸熱，不過，臺當局因應所謂“斬首”攻擊的動作，在母親節當天，演練了一項名為“玉山”的兵棋推演，該推演就在衡山指揮所進行，由“國安會”主辦，陳水扁也親自督導，層級相當高。

10日，台灣軍方和警方共同宣佈破獲一宗洩露軍事機密及偽卡集團案，逮捕莊姓現役軍官及黃姓、蘇姓男子等17人。專案小組指出，現役莊姓少校涉嫌自去年4月起，不定期將他職務掌管的國防秘密資料帶出交給黃某，再由黃某前後多次攜帶資料前往中國大陸，交給“中共”相關部門，從中獲取不法報酬。

　　17日，美國售臺的2架全新E-2T“鷹眼2000”空中預警機將在本月底之前，也就是未來10天之內運抵台灣。這2架預警機在組裝後將正式服役。與此同時，美軍還計劃協助台灣空軍全面升級臺軍現有的4架現役E-2T空中預警機的電子系統。新型預警機服役和升級的行動代號為“玄機計劃”。該計劃具體包括：提升臺軍現有C-130HE“空載電子戰平臺”、E-2T空中預警與F-16戰機間的“數據鏈”傳遞介面，以及目前仍被臺美雙方列為高度機密的“預警偵搜系統”。

 　　24日，有關台灣執政黨執意三讀的“監院”人事同意權和軍購案，在“立院”程式委員會再度遭到被封殺，確定“立院”本會期無法過關。

 　　25日，臺軍高階人事近日異動，“國防部長”李傑在“漢光21號演習”實兵操演前夕，調動策劃操演的現任“國防部作戰計劃次長”吳斯懷中將，現任馬祖防衛司令部司令程士瑜中將將接任“國防部作戰計劃次長”一職。吳斯懷調回陸軍總部接任“準則會主委”，原任“準則會主委”陸小榮中將調升馬防部司令。調任令將於6月1日生效。

　　29日，軍購案連續兩個會期在“立法院”受挫，無法付委，據了解，“國防部”目前將希望寄託于七月臨時會，同時重新檢討軍購特別預算額度，在必要的情況下，可以將三項軍購案的整體後勤預算移出，納入年度預算編列，如此，軍購案特別預算，將由現行四千八百億元，再降為四千一百億。

29日，臺軍方權威消息指出，陳水扁已批示最新的軍方人事，其在軍中的親信、軍事情報局長余連發中將將被調升“後備司令”（上將銜），6月1日生效。據悉，余連發是臺軍中第一位士官出身的臺籍上將。

 　　30日，經陳水扁親自敲定，新任“軍事情報局長”將由空軍總部參謀長彭勝竹中將接任，延續“總統府”“侍衛長”出掌“軍情局”的模式，但彭是首位空軍系統出身的“軍情局長”，將於六月一日新職布達。

 　　30日，台南縣大內鄉台灣陸軍908旅，同一天內接連發生一名軍官和一名士兵跳樓自殺，臺軍方否認管教失當，強調軍官是因為業務壓力大才一時想不開，另一位士兵則是疑似想藉跳樓受傷逃避兵役。還好兩個人都沒有生命危險，但營區士官兵的情緒管理和危機處理，已引起各界重視。還好跳樓的軍官送醫後已經脫離險境，士兵也只受到輕傷。只是官兵跳樓自殺，部隊對外說法卻反反復覆，難免會讓人有推卸責任，掩飾過失的聯想。

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