1917年7月,孫中山反對段祺瑞政府解散國會,提出擁護憲法、恢複國會的主張,樹起護法旗幟。8月間,孫中山在廣州召開國會非常會議,成立護法軍政府。9月1日,孫中山被選為軍政府大元帥,在廣州士敏土廠建立大元帥府。1918年5月辭職赴滬。
1920年1月,孫中山重返廣州主政。1921年4月,國會非常會議在廣州召開,成立中華民國政府。
1921年5月,孫中山就任非常大總統,設總統府于廣州觀音山(今越秀山)南麓。1922年6月,陳炯明叛變,孫中山再次被迫離穗赴滬。
1923年2月,孫中山在驅逐陳炯明叛軍後重返廣州,3月1日重建陸海軍大元帥大本營,仍在廣州士敏土廠設立元帥府,1925年1月,孫中山應邀北上討論國事。7月1日,廣東國民政府成立,陸海軍大元府遂告結束。(來源:中山紀念堂網站)