２００２年６月，上海合作組織成員國元首在聖彼得堡舉行第二次會晤，簽署《上海合作組織憲章》 。憲章對上海合作組織宗旨原則、組織結構、運作形式、合作方向及對外交往等原則作了明確闡述，標誌著該組織從國際法意義上得以真正建立。
根據《上海合作組織憲章》和《上海合作組織成立宣言》，上海合作組織的主要宗旨是：加強成員國之間的相互信任與睦鄰友好；發展成員國在政治、經貿、科技、文化、教育、能源、交通、環保等領域的有效合作；共同維護地區和平、安全與穩定，推動建立民主、公正、合理的國際政治經濟新秩序。
上海合作組織遵循以下基本原則：恪守《聯合國憲章》的宗旨和原則；相互尊重獨立、主權和領土完整，互不干涉內政，互不使用或威脅使用武力；所有成員國一律平等；通過相互協商解決所有問題；不結盟、不針對其他國家和組織；對外開放，願與其他國家及有關國際和地區組織開展各種形式的對話、交流與合作。
２００３年５月，上海合作組織成員國元首在莫斯科舉行第三次峰會，討論了在新形勢下如何抓住機遇、應對挑戰、加強協調、擴大合作，促進地區和平與發展等重大問題，並達成廣泛共識，簽署了《上海合作組織成員國元首宣言》。中國駐俄羅斯大使張德廣被任命為該組織首任秘書長。
２００４年１月１５日，上海合作組織秘書處在北京舉行成立儀式。
２００４年６月１７日，上海合作組織峰會在烏茲別克首都塔什幹舉行。胡錦濤主席發表了題為《加強務實合作 共謀和平發展》的重要講話。成員國當日簽署了《上海合作組織成員國元首塔什幹宣言 》。同日，設在烏茲別克首都塔什幹的上海合作組織地區反恐機構正式啟動 。
上海合作組織自成立之日起，成員國在文化、經貿、軍事、司法、安全等各領域和各層次的合作相繼展開，並不斷得到加強。“９·１１”事件後，上海合作組織成員國加強了以打擊本地區恐怖主義、極端主義和分裂主義“三股勢力”為中心的反恐合作，進一步增強了成員國間的相互信任。
上海合作組織每年舉行一次成員國元首會晤，定期舉行政府首腦會晤，輪流在各成員國舉行。秘書長由元首會議任命，由各成員國按國名的俄文字母順序輪流擔任，任期３年，不得連任。秘書長人選的遴選非常嚴格，要由上海合作組織外長會議商討推薦後，由元首會議討論批准任命，要求有１５年以上外交工作經歷，精通俄文。
上海合作組織會徽呈圓形，主體是中國、俄羅斯、哈薩克、吉爾吉斯斯坦、塔吉克和烏茲別克六個成員國的版圖、左右環抱的橄欖枝和兩條飄帶，象徵成員國為地區和世界和平與發展所起的積極推動作用，並寓意上海合作組織廣闊的合作領域和巨大的發展前景。會徽上部和下部分別用中文、俄文標注“上海合作組織”字樣。會徽選用綠色和藍色，象徵該組織和平、友誼、進步、發展的宗旨。
２００５年６月，上海合作組織在哈薩克首都阿斯塔納召開外長會議，承認印度、伊朗、巴基斯坦三國為準成員國，並將於7月5日在阿斯塔納召開的首腦會議上作出正式批准。
轉自新華網
