這是最古老的端午節俗之一。《夏小正》載：“此日蓄藥，以蠲除毒氣。”《歲時廣記》卷二十二“採雜藥”引《荊楚歲時記》佚文：“五月五日，競採雜藥，可治百病。”後魏《齊民要術·雜記》中，有五月捉蛤蟆的記載，亦是制藥用。後來有不少地區均有端午捉蛤蟆之俗，如江蘇于端午日收蛤蟆，刺取其沫，製作中藥蟾酥；杭州人還給小孩子吃蛤蟆，說是可以消火清涼、夏無瘡癤。還有在五日于蛤蟆口中塞墨錠，懸挂起來晾幹，即成蛤蟆錠，涂于膿瘡上可使消散。這種捉蛤蟆制藥之俗，源於漢代“蟾蜍辟兵”之傳說。又如湖北監利於端午“採百草”，亦採藥草之俗。採藥是因端午前後草藥莖葉成熟，藥性好，才於此日形成此俗。