該遺址是一處典型的沙丘遺址。出土的遺存有新石器時代和商時期的,其中新石器時代的遺存最為重要。根據碳十四測定的數據,該遺址應距今7000─6000年。對它的考古研究,為珠江三角洲地區距今6000年前後至近7000年間考古學文化的分期、斷代樹立了一個重要的尺規。另外,距今7000年的遺物是目前珠江三角洲地區發現的、有準確測年的人類最早的遺物,這些遺物為探尋珠江三角洲地區的古文化之源提供了重要的線索。

　　發掘表明該遺址是當時規格很高的對周圍遺址有較強輻射力或者控制力的一個中心性聚落遺址,也是目前惟一一處可以比較全面地反映珠江三角洲地區新石器時代中期考古學文化面貌的典型遺址。可以說鹹頭嶺遺址是一把鑰匙,它是深入認識珠江三角洲地區新石器時代中期考古學文化的關鍵之一,通過對該遺址的深入研究,有望為解決一些久而未決的嶺南史前考古問題提供重要的線索。